Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm5dQ62240 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm5dQ62240 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms