Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtprrQ62132 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms