Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Odf1Q61999 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Odf1Q61999 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Odf1Q61999 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Odf1Q61999 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Odf1Q61999 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Odf1Q61999 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Odf1Q61999 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Odf1Q61999 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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