Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msi1Q61474 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.9 ms