Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Foxg1Q60987 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms