Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf3Q60980 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms