Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrkQ60976 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrkQ60976 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrkQ60976 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrkQ60976 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JrkQ60976 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JrkQ60976 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms