Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms