Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik1Q60934 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik1Q60934 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms