Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin1Q60865 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms