Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Slc6a4Q60857 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Slc6a4Q60857 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Slc6a4Q60857 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Slc6a4Q60857 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Slc6a4Q60857 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Slc6a4Q60857 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms