Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r1bQ60829 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms