Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxd4Q60688 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxd4Q60688 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms