Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Arcn1Q5XJY5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arcn1Q5XJY5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arcn1Q5XJY5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arcn1Q5XJY5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arcn1Q5XJY5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Arcn1Q5XJY5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Arcn1Q5XJY5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Arcn1Q5XJY5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arcn1Q5XJY5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arcn1Q5XJY5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arcn1Q5XJY5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arcn1Q5XJY5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arcn1Q5XJY5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Arcn1Q5XJY5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arcn1Q5XJY5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arcn1Q5XJY5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arcn1Q5XJY5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arcn1Q5XJY5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arcn1Q5XJY5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arcn1Q5XJY5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arcn1Q5XJY5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms