Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Scaf1Q5U4C3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Scaf1Q5U4C3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scaf1Q5U4C3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scaf1Q5U4C3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scaf1Q5U4C3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms