Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tsr1Q5SWD9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms