Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam71bQ5STT6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms