Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sft2d1Q5SSN7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms