Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r223Q5SSA0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r223Q5SSA0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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