Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brsk1Q5RJI5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brsk1Q5RJI5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brsk1Q5RJI5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brsk1Q5RJI5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brsk1Q5RJI5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brsk1Q5RJI5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brsk1Q5RJI5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brsk1Q5RJI5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brsk1Q5RJI5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brsk1Q5RJI5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brsk1Q5RJI5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brsk1Q5RJI5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brsk1Q5RJI5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brsk1Q5RJI5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms