Protein–RNA interactions for Protein: Q5QNQ9

Col27a1, Collagen alpha-1(XXVII) chain, mousemouse

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Length 1,845 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col27a1Q5QNQ9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Col27a1Q5QNQ9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col27a1Q5QNQ9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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