Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Trappc1Q5NCF2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Trappc1Q5NCF2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms