Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trim41Q5NCC3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim41Q5NCC3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim41Q5NCC3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim41Q5NCC3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim41Q5NCC3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim41Q5NCC3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim41Q5NCC3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim41Q5NCC3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim41Q5NCC3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim41Q5NCC3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim41Q5NCC3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim41Q5NCC3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim41Q5NCC3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim41Q5NCC3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim41Q5NCC3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim41Q5NCC3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim41Q5NCC3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms