Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
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Spata48Q5NC83 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Spata48Q5NC83 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Spata48Q5NC83 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Spata48Q5NC83 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Spata48Q5NC83 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Spata48Q5NC83 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spata48Q5NC83 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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