Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ecm2Q5FW85 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ecm2Q5FW85 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms