Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms