Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Nlrc3Q5DU56 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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Nlrc3Q5DU56 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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