Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms