Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufaf2Q59J78 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms