Protein–RNA interactions for Protein: Q562D6

Trmo, tRNA (adenine(37)-N6)-methyltransferase, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmoQ562D6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TrmoQ562D6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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TrmoQ562D6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmoQ562D6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms