Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc47Q505F5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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