Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc3lQ4KL14 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms