Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt35Q497I4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt35Q497I4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms