Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg1lQ3V384 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms