Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ulk4Q3V129 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms