Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms