Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b4Q3V0X2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b4Q3V0X2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms