Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrc43Q3V0L5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc43Q3V0L5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms