Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp48Q3V0C5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms