Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slfn4Q3UV66 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms