Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B230104I21RikQ3USW4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16■□□□□ 0.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms