Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TceancQ3US16 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TceancQ3US16 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms