Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx21Q3UR97 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms