Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec31aQ3UPL0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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