Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmem253Q3UNB8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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