Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrch2Q3UMG5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrch2Q3UMG5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms