Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cog7Q3UM29 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms