Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxosQ3UL53 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxosQ3UL53 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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