Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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