Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Usp19Q3UJD6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Usp19Q3UJD6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Usp19Q3UJD6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Usp19Q3UJD6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp19Q3UJD6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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